Вуз был создан в соответствии с приказом ВСНХ СССР №1381 от 18 мая 1930 года и постановлением ЦК и Совнаркома СССР №40/237 от 23 июня 1930 года. Он открылся на базе инженерно-строительного факультета Сибирского технологического института (г. Томск). Переехавший в 1933 году из Томска в Новосибирск Сибстрин стал не просто первым строительным вузом города, но и единственным от Урала до Дальнего Востока научно-образовательным центром, ведущим подготовку кадров для строительного сектора страны.

Создан в 1932 году на базе путейско-строительного факультета Сибирского института инженеров транспорта, располагавшегося в Томске. В 1934 году был преобразован в Новосибирский институт военных инженеров транспорта (НИВИТ).

С 1932 по 1941 год НИВИТ располагался в зданиях, находящихся ныне на территории Новосибирского приборостроительного завода. В 1941 году эти здания были заняты эвакуированным заводом, и обучение с 1941 по 1955 год шло в доме по адресу Советская, 20 (ныне Советская, 18). Главный корпус института построен в 1949-1955 годах на улице Дуси Ковальчук, 191, по проекту московского архитектора В.С.Масленникова.В 1953 году НИВИТ был преобразован в Новосибирский институт инженеров железнодорожного транспорта (НИИЖТ). В 1993 году институту был присвоен статус академии (Сибирская государственная академия путей сообщения - СГАПС), в 1997 году - университета (Сибирский государственный университет путей сообщения - СГУПС).

Ещё в 1909 году А.Д.Крячков положил начало архитектурной школы Сибири на инженерном отделении Томского технического института. В 1930 году на этой базе создаётся Томский строительный институт, а к сентябрю 1933 он был переведён в Новосибирск. К концу 60-70-х годов на факультете сформировалась сибирская архитектурная школа, что привело в 1989 году к открытию на базе архитектурного факультета Новосибирского инженерно-строительного института им. В. В. Куйбышева Новосибирского архитектурного института (НАрхИ). Институт начинает свою работу первого сентября 1989 года, под руководством ректора Пустоветова Геннадия Ивановича, став четвёртым специализированным архитектурным высшим учебным заведением в России. В 1993 году НАрхИ, благодаря Г.И.Пустоветову, переехал в центр Новосибирска, в здание, являющееся памятником архитектуры начала XX в. и построенное по проекту архитектора А.Д.Крячкова. В марте 1996 года институт переименован в Новосибирскую государственную архитектурно-художественную академию (НГАХА). В сентябре 2015 НГАХА переименована в Новосибирский государственный университет архитектуры дизайна и искусств (НГУАДИ).

Новосибирский государственный университет был создан Постановлением Совета Министров СССР от 9 января 1958 года через полгода после решения о создании Сибирского отделения Академии наук СССР. Занятия начались 29 сентября 1959 года - академик С.Л.Соболев прочитал первую лекцию студентам нового университета.

В 1978 году университету было присвоено имя Ленинского комсомола. В 1984году он был награжден орденом Трудового Красного Знамени. Сегодня НГУ - один из ведущих вузов страны, ориентированный на подготовку высококвалифицированных специалистов по приоритетным направлениям развития науки и технологий. Университет строился и развивался вместе с Новосибирским научным центром, ориентируясь на подготовку высококвалифицированных кадров для науки и образования.

17 августа 1935 года вышло Постановление Совнаркома СССР № 1818 об открытии в Сталинграде, Ленинграде и Новосибирске медицинских институтов. Новосибирский медицинский институт создавался на базе Омского и Томского медицинских институтов и Новосибирского института усовершенствования врачей (также переехавшим из Томска в 1932 году). На момент открытия институт имел лишь лечебный факультет. Директором был назначен Исаак Лившиц, его заместителем и основным организатором учебного процесса являлся Б.Я.Жодзишский. До 1999 года носил название Новосибирский ордена Трудового Красного Знамени медицинский институт (НоТКЗми), с 1999 по 2005 годы - Новосибирская государственная медицинская академия.

С 1996 по 2007 года вуз возглавлял д.м.н., профессор А.В.Ефремов. 21 февраля 2008 года ректором НГМУ избран д. м. н., профессор Игорь Олегович Маринкин.

Новосибирская государственная консерватория имени М.И.Глинки - высшее музыкальное учебное заведение в Новосибирске. Основанная в 1956 году распоряжением совмина РСФСР и указом министерства культуры РСФСР, консерватория стала первым музыкальным высшим учебным заведением в Сибири и до сих пор остаётся единственным за пределами европейской части России. С 1957 года она носит имя Михаила Ивановича Глинки. Здание, в котором располагается консерватория, было построено в 1923-1924 годах по проекту архитектора Андрея Крячкова для "Дальторга". В 1960-е годы к зданию консерватории был пристроен четвёртый этаж и две боковые пристройки, из-за чего оно не смогло получить статус памятника архитектуры.

Создан 5 мая 1951 года приказом министра речного флота РСФСР в Новосибирске как Новосибирский институт инженеров водного транспорта (НИИВТ).

В 1994-2015 годы - Новосибирская государственная академия водного транспорта (НГАВТ). С 2015 года - Сибирский государственный университет водного транспорта (СГУВТ). Авторы - инж.-арх. С.А.Шестов; реконструкция 1936 г. - арх. И.С.Алексеев, Т.Я.Бардт.