Открытие фольклорно-этнографического отделения в 1994 г. стало результатом осмысления современной культурной ситуации. Это связано, прежде всего, с утратой музыкального, национально-ориентированного воспитания в семье, с забвением в нашей стране основ аутентичной народной культуры. Была осознана необходимость возрождения народных традиций: музыкального, семейного, духовно-нравственного, психолого-педагогического и физического воспитания. В связи с этим основной целью работы отделения стала подготовка специалистов в области народной художественной культуры, руководителей фольклорно-этнографических коллективов, преподавателей.

В основу концепции работы отделения был положен принцип практического освоения традиционной культуры в сочетании с глубокой теоретической подготовкой учащихся, который остаётся неизменным, несмотря на смену структуры учебного процесса и документации, продиктованную обновлением образовательных стандартов.

У истоков отделения стояли:

• профессор НГПУ, член Петровской академии наук и Союза писателей России, сибирский фольклорист М.Н. Мельников;
• кандидат искусствоведения, профессор кафедры этномузыкознания Новосибирской государственной консерватории им. М.И. Глинки Н.В. Леонова;
• член Союза композиторов России, вице-президент Российского фольклорного союза В.В. Асанов.

Ведущие специалисты в области традиционной культуры Новосибирска, такие как В.В. Асанов, Н.В. Леонова, Е.Ф. Фурсова, В.С. Кузнецова, Т.Е. Потехина, Н.С. Индан (Кутафина), работали над созданием учебных планов и программ для первого набора студентов.

В 1995 году отделение имело две секции. Собственно фольклорная секция с музыкальной специализацией готовила руководителей фольклорных ансамблей аутентичной ориентации, преподавателей музыкально-фольклорных дисциплин центров традиционной культуры, школ искусств, эстетических центров. Декоративно-прикладная секция готовила руководителей (преподавателей) детских художественных студий и кружков народных ремесел.

Учебные планы обеих секций включали общеобразовательный, профилирующий и специальный циклы дисциплин.

Специальный цикл состоял из теоретических дисциплин лекционного типа, которые изучались фольклористами и прикладниками параллельно в одинаковом объёме.

Практические дисциплины (групповые и индивидуальные) также осваивались студентами обеих секций, но в разном объёме в зависимости от избранной специализации. Профилирующими дисциплинами для фольклористов являлись "Расшифровка народных песен", "Анализ народной песни", "Сольфеджио", "Элементарная теория музыки", "Методика работы с фольклорно-этнографическим коллективом", "Фольклорный певческий голос" и т.д.

Студенты декоративно-прикладной специализации изучали "Виды и жанры изобразительного искусства", "Русское и зарубежное изобразительное искусство", проходили "Школу изобразительного и профессионального мастерства" и практику у народных мастеров.

В 1997-1998 учебном году от Фольклорно-этнографического отделения откололась декоративно-прикладная специализация и сформировалась новая учебная структура - Декоративно-прикладное отделение НОККиИ.

На протяжении истории ФЭО делался акцент на комплексный подход в освоении традиционной культуры, представленной в образовательном процессе как взаимосвязь теоретического (научного) и практического (исполнительского) компонентов. Также был разработан и успешно претворен комплексный метод усвоения музыкального фольклора, который опирался на базовые принципы:

1. образовательный процесс осуществляется с использованием аутентичных фольклорных образцов;
2. используются характерные свойства фольклора: традиционность, устность, синкретизм, вариативность, коллективность и функциональность;
3. погружение обучающихся в традиционную народную культуру посредством специально организованной педагогической деятельности, содержание которой обусловлено тесной взаимосвязью духовного, музыкально-фольклорного, прикладного, познавательного и бытийно-практического компонентов, реализуемой посредством междисциплинарных связей и разнообразных форм практического обучения;
4. в соответствии с особенностями педагогических форм, методов и приемов наследования подлинных народных традиций в современных условиях.

Обучение на ФЭО базируется на современных образовательных принципах, но нацелено на познание и сохранение национальной традиционной культуры.

Развитие ФЭО было невозможно представить без научной и практической деятельности, которая связана с широкомасштабными экспедициями преподавателей и студентов по районам Новосибирской области, Сибирскому региону и Уралу. Записанные народные песни, танцы, обряды составляют учебный и исполнительский репертуар певческих коллективов фольклорно-этнографического отделения. Для сохранения и изучения экспедиционного материала был создан архив традиционной музыки. В настоящее время в нём хранится свыше двух тысяч фольклорно-этнографических образцов, в основном записанных в 29 районах и 80 населенных пунктах нашей области.

Собранный материал обрабатывается, систематизируется и выносится на рассмотрение специалистов и любителей фольклора в виде различных издательских проектов. В частности, была опубликована серия сборников "Фольклорная карта Новосибирской области", куда вошли материалы, записанные в Мошковском, Кыштовском и Чановском районах Новосибирской области.

Результаты собирательской и аналитической деятельности преподавателей и студентов неоднократно были представлены на различных научно-практических конференциях во многих городах России.

Студенты и преподаватели ФЭО - постоянные участники международных, всероссийских, межрегиональных конкурсов и фестивалей. Они выступают и как организаторы масштабных областных мероприятий и праздников.

Копилка отделения ежегодно пополняется десятками наград и поощрений.

Выпускники ФЭО успешно продолжают обучение в высших учебных заведениях страны, возглавляют творческие коллективы и культурные заведения Новосибирской области.

На отделении трудятся преподаватели, которые сами были его выпускниками: почётный работник культуры Новосибирской области Ольга Александровна Кайманакова, Евгения Владимировна Мягкова, Елизавета Вячеславовна Доронина, Руслан Александрович Галкин. С самого основания работают Марина Михайловна Андреева и Наталья Борисовна Близневская.

В разные годы фольклорно-этнографическим отделением заведовали: Аникеева Галина Николаевна, Кутафина Наталья Семеновна, Шмакова Ирина Сергеевна, Кайманакова Ольга Александровна, Конева Елена Васильевна.

С начала организации фольклорно-этнографического отделения (ФЭО) в учебных целях был создан ансамбль "Радоница", который стал победителем нескольких фольклорных форумов Российского фольклорного союза (РФС).

С 2004 года ансамбль ФЭО переименован в "Сибирочку" (руководитель Е.В. Конева). Это коллектив аутентичной ориентации, бережно сохраняющий фольклорные традиции восточнославянских переселенцев Сибири. Кроме того, участники ансамбля осваивают различные жанры народного театра.

При выборе репертуара преподаватели опираются на материалы коллекции архива традиционной музыки, собранного преподавателями и студентами фольклорно-этнографического отделения НОККиИ в основном на территории Новосибирской области. Ансамбль имеет большой опыт работы с людьми разных возрастных категорий, организовывает и проводит мероприятия различных форм и масштабов.

В 2009 году на ФЭО был создан фольклорно-этнографический проект "Новоград" (худ. руководители - О.А. Кайманакова, А.Г. Стародубцев), который ориентирован на стиль этнофьюжн, предполагающий сочетание многоголосного аутентичного исполнения подлинных песенных образцов и разнообразных инструментальных аранжировок.

Особой вехой в истории ФЭО стали фольклорные музыкальные спектакли. Ежегодно отделение выпускает новый спектакль, каждый из которых становится значимым событием в культурной жизни города. К числу наиболее заметных их них относятся: "Волшебный подарок", "Деревенский романс", "За тридевять земель", "Купчиха", "Майская ночь" и другие.